环境工程是环境科学与工程一级学科所属的两个二级学科之一。目前环境工程学科科研基地共承担了国家“863”项目、国家“十五”攻关重点科研项目、国家自然科学基金项目、科技部以及市科委重点项目、市教委重点项目、北京市基金及横向科研项目50余项，合同总经费达到2000余万。近3年发表学术论文300余篇，出版专著教材9部，获国家、省部级奖及鉴定8项。
环境工程学科的主要任务是研究保护和改善环境质量的技术原理和工程措施。长期以来主要从事的研究内容包括：水污染控制新技术、城市污水深度处理技术和超深度处理与回用技术、城市污水综合利用与资源化、城市水环境与污水处理的地理信息系统与科学化管理及计算机模拟仿真技术；尘污染治理工程、有机废气净化技术；膜材料的研制及其在污染控制工程中的应用；环境规划与管理新方法的研究；城市生活垃圾处理与资源化等。本专业主要有以下三个研究方向：污水处理与水污染控制工程、大气污染控制工程及催化技术、环境规划与管理（包括环境监测）。
近些年来，先后研制与开发了污水生物处理与脱氮除磷的新技术及模糊控制系统、高浓度有机废气净化的新方法、利用膜技术处理废水等多项研究成果。在环境规划与管理研究方向完成了多维多箱空气质量预测模型的开发与研制、城市空气环境质量达标规划和优化新方法的研究、地理信息系统在环境管理中的应用等课题。
