北京大学哲学系始建于1914年，是我国高等学校中最早成立的哲学系。创建之初为北大文科哲学门，亦称中国哲学门，1919年更名为哲学系。历史上，著名学者蔡元培、马叙伦、章士钊、胡适、熊十力、梁漱溟、汤用彤、张申府、金岳霖、冯友兰、贺麟、朱光潜、张岱年、宗白华、洪谦、王宪钧等先后在这里执教。中国共产党的创始人陈独秀、李大钊等人也曾在此开设哲学课程，最早在中国传播马克思主义。1937年，由于日本发动全面的侵华战争，哲学系随校内迁，在云南昆明与清华、南开的相关科系合组为西南联合大学哲学系。抗战胜利后，1946年北大复校，哲学系也随校北上，恢复为北大哲学系。

　　1952年全国院系调整，部分高校哲学骨干教师汇入哲学系，进一步壮大了哲学系的阵容。1978年，心理学专业从哲学系分出，独立成为心理学系。

　　1978年以来，哲学系在改革开放的环境里快速发展，学科门类逐步完备，教师配备渐趋合理，图书资料日益丰富，科研条件极大改善。

　　1994年起列为国家文科基础学科人才培养和科学研究基地。1998年被国务院学位委员会批准为哲学一级学科博士点，在哲学的全部8个二级学科（马克思主义哲学、中国哲学、外国哲学、美学、伦理学、逻辑学、宗教学、科学技术哲学）招收博士和硕士研究生。1999年经教育部批准设立哲学学科博士后流动站。

　　由于学科发展的需要，1995年9月宗教学由原来与哲学、逻辑学并列的专业独立成系。按照一种新的办学模式，宗教学系与哲学系联体运作，以求协力发展。

　　目前，哲学系（宗教学系）拥有3个本科专业：哲学、逻辑学、宗教学；1个本科辅修专业：哲学。在8个二级学科设立9个教研室：马克思主义哲学教研室、中国哲学教研室、外国哲学教研室、逻辑学教研室、伦理学教研室、美学教研室、佛教道教教研室、基督教与宗教学原理教研室、科学技术哲学教研室。

　　1个与系合作的研究所：北京大学外国哲学研究所（教育部人文社会科学百所重点研究基地）。

　　1个挂靠的科研机构：北京大学科学与社会研究中心。

　　7个虚体研究机构：北京大学马克思主义文库、北京大学中国哲学与文化研究所、北京大学宗教研究所、北京大学人学研究中心、北京大学现代科学与哲学研究中心、北京大学应用伦理学中心、北京大学科学传播中心。

　　2000年，哲学系创办了面向整个华语哲学界的学术刊物《哲学门》（半年刊，湖北教育出版社出版）。目前，图书资料室藏书已达3万5千余册，学生计算机室机位18个，教师工作室机位24个，人文信息实验室装备多台服务器，独立创建和维护哲学系网站。

　　截止2001年9月，哲学系、宗教学系在职教师61人，其中教授27人（包括26名博士生导师），副教授27人，讲师7人。两系学生总数438人，其中本科生178人（98级44人、99级41人、00级51人、01级42人），硕士生151人（99级47人、00级55人、01级49人），博士生109人（99级34人、32人、43人），其中留学生40人（硕士11人，博士29人）。

　　80多年来，哲学系共培养了8000余名毕业生，其中有冯友兰、张申府、朱自清、顾颉刚、王浩这样的大学者，也有邓中夏这样的革命志士，还有各行各业的大批骨干力量。这些毕业生遍布海内外，为中华民族的振兴和人类文明的发展作出了巨大的贡献。在致力于教学的同时，哲学系的教师写出了许多富有创见的学术著作，在国内外产生了很大的影响。

　　北京大学哲学系对20世纪中国哲学的发展起了重大的推动作用，并且还将在21世纪对人类文明继续作出应有的贡献。