基础医学院集教学、科研及学生管理为一体，其前身即基础医学部，成立于1987年底，2000年改建为基础医学院。现有物理数学、化学、遗传与细胞生物学、人体解剖学、组织胚胎学、病理学、寄生虫学、微生物与免疫学、生理学、病理生理学、生物化学、药理学十二个教研室。以及机能、形态学及分子生物学三个实验室；有解剖学、病理学、寄生虫学、生理学、病理生理学、生物化学和药理学等七个硕士授予点及相应的研究室，设有院办公室及学生工作办公室。
　　
　　学院现有教职工198人，其中教授18人，副教授46人，具有博、硕士学位教师39人，全国优秀教师3名，省级有突出贡献优秀专业技术人才及省级优秀教师6名。
　　
　　学院在确保全院本科临床医学、口腔、药学、预防、法医、检验、麻醉、护理等各专业教学任务的同时，还承担其它二级学院各专业研究生及成教、高职教、自考等不同层次学生的大量教学任务。开设必修课40余门，选修课10余门。
　　
　　人体解剖学及生物化学为省级重点课程；心脑血管病理生理学、心血管药理学及肿瘤病理学为省级重点学科；生理学、病理学、物理学、组织胚胎学、化学、寄生虫学、微生物与免疫学7门课程被评为院级一类课程；编撰教材46部；先后获教学成果奖30余项，其中国家级教学成果奖一项，省级教学成果奖10项；科技成果奖近60项，其中国家卫生部医药科技进步三等奖4项，省级自然科学及科技进步二、三等奖20余项；在国内外学术期刊发表科技论文近400余篇，被国际权威检索系统SCI收录10余篇，名列全院之首。