沈阳药科大学中药学院现有天然药物化学系和中药系。学院现有教职工60人，专业教师39人，88%的教师有硕士学位，44%的教师有博士学位，60%的教师是留学归国人员。他们当中有中国工程院院士一人，教授、副教授27人，博士生导师10人，硕士生导师24人。他们当中有国务院学位委员会药学评议组组长、全国博士后管委会医学专家组一组召集人、国家科委新药研究常务委员会专家委员会委员、国家进步奖评委、国家药典委员会委员等。

　　中药学院科研队伍阵容齐整，学术氛围浓厚，研究成果可观。先后承担国家“攀登计划”、国家“九七三”“八六三”高新基础科研项目和国家自然科学基金重点项目5项。累计发表论文1600多篇，被SCI收载的80多篇。教师出席和共同主持各种国际学术会议、做大会报告、特邀演讲等累计150人次。申报和获得多项国家专利和新药证书。获得国家、省、市级科技成果奖励50多项次。目前学院教师和科研人员与日、美、意、法、德、澳、韩等20多个国家以及台湾和香港地区的专家学者建立密切的合作关系，学院每年都要派出留学生和高访人员去国外进修学习，并接待大批国内外来访的专家学者及外国留学生来院学习。

　　中药学院下设天然药物化学系和中药系。天然药物化学系和中药系。天然药物化学教研室和天然药物化学研究室组成。中药系由生药学教研室、中成药分析鉴定教研室、药物植物教研室和药用植物园组成。原国家医药管理局天然药物工程技术研究中心、原国家医药管理局新药研究管理中心沈阳中药质量标准研究重点实验室等在国内外有一定影响的医药开发研究机构均附设在中药学院。

　　学院设党总支办公室、学院办公室、辅导员办公室，负责日常的组织管理、行政管理和学生管理工作。