药学院是沈阳药科大学历史最悠久的教学管理机构，从1932年10月起即开始招收调剂班学员；1940年将调剂班改为药科班；1948年成立药学专科；1949年将药剂专科改为药剂系；1958年正式更名为药学系；2001年4月，在原有药学系的基础上，并入了物理化学教研室、分析化学教研室、仪器测试中心、药物代谢与药物动力学实验室，正式组建药学院。

　　药学院现有教职员工138人，下设三个系——药剂系、药分系和药理系，共15个教研室，其中，药剂系包括5个教研室——药剂Ⅰ室、药剂Ⅱ室、药剂Ⅲ室、物理化学教研室、药剂实验室；药理系包括5个教研室——药理教研室、生理教研室、机能实验室、GLP中心和实验动物中心；药分系包括5个教研室——药物分析教研室、分析化学教研室、药物代谢与药物动力学实验室、分析化学中心实验室和仪器测试中心。

　　经过顾学裘等老一代药学专家的数十年的辛勤建设和发展，我院如今已成为基础坚实、实力雄厚、居于国内先进水平，在国际上有较大影响的药学院，各类课程均有学科带头人和骨干教师，荟萃着众多的药学专家、教授和学者，老中青人才济济，他们具有丰富的教学实践经验和很强的科学研究能力，研究方向十分广泛。药学院现有教授24人，副教授32人，高级工程师8人，硕士生导师45人，博士生导师17人。教师中获博士学位24人，硕士学位43人，占教师总数的77.6 %，现正攻读博士学位26人。学院有30余人分别担任了国务院学位委员会学科评议组成员、国家自然科学奖科技进步奖评委、卫生部医药科学委员会药学专题委员会委员、国家药典委员会委员、国际和国内学术团体的领导以及国际性、全国性期刊杂志的正副主编或编委，在国内享有较高声誉。

　　学院在出色完成各层次的教学任务的同时，还承担了国家新药研究基金科研项目6项，以及国家、省、市下达的其它科研任务50多项，并取得了一系列科研成果，不少项目达到了国际先进水平，许多项目填补了国内空白。目前，学院拥有国家级重点学科——药剂学科、国家级重点实验室——沈阳新药安全评价中心和辽宁省级重点学科——药物分析学科。药剂学科还设有特聘教授岗位。学院综合办学条件优良，基本设施齐全，能够充分满足教学、科研的需要。学院拥有LC—MSn、LC—MS、300MHz超导核磁共振仪、GC—MS、红外分光光度计、旋光仪、元素分析仪、数台高效液相色谱仪等从事应用基础研究和新药开发研究的各种大型精密仪器设备。

　　药学院在长期的办学实践中，以严谨的学风、执着的科学创新精神创造出了丰硕的成果，目前已经发展成为多学科、多层次、富有特色的二级学院。药学院现有药学博士后流动站1个，药学一级学科博士学位授权点1个（二级博士学科3个，包括药剂学、药理学和药物分析学），硕士学科点3个，本科专业3个，含7个研究方向：药学国家理科基地班、药学英语班、药学日语班、临床药学班、药学班、药物制剂班和环境科学班，其中，国家理科基地班是在1996年被国家教委批准的、在省属高校中唯一的国家理科基础科学研究和教学人才培训试点，五年制的药学英语班和日语班在国内外也有较大的影响。现全院共有全日制在校生1914人，占全校学生总数的45%，其中本科生1562人，研究生352人（其中博士研究生82人，硕士研究生270人），我院还有54名学员在职攻读博士学位。

　　在对学生的教育管理过程中，学院始终坚持以德育教育为核心，以学风建设为主线，全面推进素质教育，培养了一大批具有较高综合素质的合格人才，近几年有近三分之一的应届毕业生考取了研究生。我院培养的学生以其良好的职业道德、扎实的专业功底和很强的综合能力，深受用人单位的欢迎和好评，毕业生供不应求。多年来，药学院为国家培养了大批高级药学人才，其中很多人成绩卓著，已成为闻名中外的专家、学者和企事业的领导骨干，有二人当选为两院院士。