学院下设三系一室一站，分别是动物基础科学系、动物科学系、动物医学系、院中心实验室、畜牧站；有河南省牛业工程研究所、家禽研究室、草食家畜研究室、畜禽疫病防治研究室和动物营养研究室等科研机构。

　　学院现有价值800元以上的各种仪器设备996台件，仪器设备总价值近千万元，全面改善实验室条件和科研条件，大大提高了教学质量和科研水平。近年来，我院先后主持国家重中之重科技攻关项目、国家自然科学基金项目、863项目等国家级项目6项，农业部跨越计划、河南省重大、重点科技攻关项目8项、其它科学研究项目90多项，教学研究项目25项，有50多项科研成果获得校级以上奖励。

　　学院始终把全面推进素质教育，提高学生综合素质作为学生工作的重中之重。大力倡导团结奋进，力争上游，遵从集体，爱我牧医的牧医精神，培养学生把踏踏实实工作，堂堂正正做人作为做人准则，把团体争先进，单项争第一作为工作目标，从1993年至今，我院连续六次代表学校参加挑战杯全国课外科技学术作品竞赛；连续17次问鼎校运会团体总分第一名；连续举办5期大学生素质培训学校，培训学员2000余人；先后邀请企业界知名人士70多人次为我院学生主讲企业家课堂；率先在河南省创建大学生创业中心。

　　学院现已稳定健康地走上了以教学为中心、积极进行科研、适度发展产业的综合性建设轨道。

　　历史沿革

　　牧医工程学院前身是畜牧兽医系，始建于1929年，当时隶属于河南省省立中山大学农科。1930年改为河南大学农学院畜牧系。抗战期间，随学校辗转迁徙于镇平、嵩县。1939年转移并入陕西杨凌（武功）西北农学院。1950年河南大学重建，设畜牧兽医专修科，1951年设畜牧兽医系。1952年，在全国高校院系调整中，兽医专业并入江西农学院，畜牧专业并入华中农学院。院系调整后，保留了畜牧兽医教研室和动物教研室。1958年学校恢复了畜牧专业，最初由农学系代管；1959年恢复畜牧兽医系和畜牧专业招生，1960年开始招收兽医专业。1964年畜牧兽医楼竣工启用，当时是全校唯一的系级教学楼。在国家刚刚度过三年经济困难时期，投资装备了畜牧兽医系的生理生化、微生物与传染病、病理几个基础与专业基础实验室，为加强这几个学科的发展注入了宝贵的活力，为改革开放以后学院几个硕士点和重点学科的建设奠定了基础。

　　文化革命期间，畜牧兽医系历经商丘办学（1969年元月至7月），遂平下乡（1969年11月-1971年春），搬迁许昌（1974年春-1980年）几次动荡，教学、科研蒙受重大损失，一大批骨干教师调离，招生先后中断七年（1966、1967、1968、1969、1970、1971、1973年）。

　　改革开放以后，学校由许昌搬回郑州，畜牧兽医系进入稳定全面发展阶段。1972年—1976年招收畜牧兽医专业，1977年—1979年招收兽医专业，1980年恢复招收畜牧、兽医两个专业，1987年增加了卫检专业招生，1988年又增加了营养专业，1993年撤系建院，1999年根据教育部新专业目录，卫检、营养专业停止招生，我院又申报了药物制剂专业，2002年增加了生物工程专业，2003年增加了草业科学专业，2004年增加了动植物检疫专业。在专业增加和招生规模扩大的情况下，我院1996年对牧医楼加层，此后学校桃李园学生公寓和工程楼的相继竣工，这一切都为学院的发展提供了必要的基础条件。在改革开放各项政策的指引和国民经济迅速发展的带动下，牧医工程学院从基础设施到学科建设，从师资力量到专业设置，从总体规模到教学工作水平都取得了长足的发展。

　　七十五年来，学院共培养本科生3880多人，硕士研究生80人。他们正辛勤工作在教育、科研、党政、企业等行业，已经或正在做出出色的贡献，为全面建设小康社会、为中华民族的复兴在努力拼搏。