西南民族大学于1986年经国务院学位委员会批准硕士学位授单位，1987年开始招收硕士研究生。现有28个硕士点和1个博士点获得学位授予权，分属于哲学、法学、文学、历史学、理学、工学、农学、管理学九大学科门类。已招收硕士研究生17届，授予学位14届。2002年招收硕士研究生111名，2003年招收硕士研究生180人，目前在校研究生共363人。

　　2001年，学校与英国曼彻斯特大学建立了校际合作关系，并就合作培养研究生达成了协议。首批赴英留学的研究生通过雅思英语及各项考试，于2002年8月到曼彻斯特大学攻读硕士学位，现已部分回学校工作。