微生物学专业以农业和环境微生物、动植物病毒为研究对象，开展微生物和病毒的基础生物学、分子生物学特性和生态学研究，建立微生物和病毒遗传与信息资源数据库，利用有益微生物和病毒控制农业病虫害的发生和治理环境微生物污染，建立动植物与食品有害微生物和病毒的快速诊断和检测技术。利用现代分子生物学手段对微生物和病毒进行遗传工程改良，微生物基因组和功能基因研究，构建重组病毒疫苗，研究人畜共患病毒及其传播机理是本专业重点发展方向。

　　研究方向：

　　1、病毒分子生态学

　　主要从事昆虫病毒分子生态学和病毒资源与环境治理研究，结合昆虫组织病理和超微结构，从整体水平、细胞水平和分子水平研究昆虫病毒与宿主的分子机理，用大规模、高通量的方法探讨病毒与宿主在遗传、变异等方面的进化规律。利用基因工程技术对杆状病毒进行遗传改良，并对重组病毒的杀虫效果及生物安全性进行研究。同时开展病毒对靶标害虫调控机理，系统研究杆状病毒在宿主种群的流行规律，建立相应的计算机模型，为合理、高效应用病毒杀虫剂提供指导。

　　2、病毒遗传变异与分子进化

　　主要以医学病毒、动物病毒开展分子分类、病毒遗传变异与分子进化研究，结合生物信息技术，开展病毒遗传资源与重要功能基因组研究，发展病毒分类鉴定技术，完善我国病毒资源数据库的建设和生物信息资源的开发利用。

　　3、微生物分子遗传学

　　主要研究微生物杀虫毒素蛋白特性、毒素蛋白作用方式及结构和功能间的关系、杀虫毒素基因及其它功能基因的克隆和表达、杀虫微生物的遗传改良、重组杀虫工程菌的安全性、害虫对生物杀虫剂的抗性机理及防治对策、微生物杀虫剂的发酵生产工艺及应用技术等。重点开展芽孢杆菌的基因学和功能基因研究。

　　5、环境微生物学

　　研究微生物对有机污染物的降解机理，运用分子生物学和生物化学方法来鉴定代谢降解途径及相关基因，研究降解基因的组成、调控及其进化，并进行相关的生物修复及其分子生态学研究；代谢途径中显示出优良催化选择性的相关酶也将用于研究合成手性药物前体等其他复杂功能化合物。并将代谢工程和微生物后基因组学运用于环境生物技术和生物催化/转化。

　　6、生物安全监测与控制

　　主要开展微生物抗干扰灵敏快速检测技术研究、食源性致病微生物分子检测技术研究、环境水质快速检测技术研究及食源性与环境致病菌、病毒的杀灭机理和检测模型研究，研发微生物抗干扰快速测定系统、食源性致病微生物分子诊断试剂盒、环境水质污染指标在线快速检测试剂盒以及系列化的环保高效消毒剂。

　　7、微生物工程

　　主要开展农业微生物工程的研究与开发，主要包括昆虫病原微生物的筛选、发酵工程、剂型化技术及应用技术；微生物源先导化合物的高通量筛选、结构鉴定及开发；植物根际生态修复微生物制剂的研究与开发、农业环境微生物制剂的开发等。