药学系拥有独立的、设施优良的研究实验楼，总面积 4300m 2 ；拥有先进的用于药物发现、药物化学和药物生物学研究的配套大型仪器设备，总价值达 3000 多万元。现设置有 天然药物化学、药物合成、海洋糖化学与糖工程、分子药理学、生物技术、药物分析等六个研究室和海洋药物信息中心；有 3 个设施与条件先进的基础教学实验室。

　　药学系现设有药学 本科专业，生药学、药物化学两个硕士点和药物化学博士点及博士后流动站， 形成了我国 海洋药物领域 唯一的由本科到硕士、博士及博士后 完善的人才培养体系。已培 养 博士 25 名，硕士 57 名，本科生 150 余人，出站的博士后 1 人； 现在站博士后 2 人、在读博士生 60 人，硕士生 92 人，本科生 220 余人。 绝大多数毕业生已成为我国海洋药物研究领域教学科研的骨干力量。

　　药学系在海洋药物研究领域成绩显著。 已主持完成了国家和省部级项目 20 余项；现主持承担包括国家“ 973 ”项目、“十五”国家 863 计划项目等国家和省部级项目 40 余项。 发表论文近 350 篇，其中 SCI 收录 77 篇；申请国内外发明专利共 63 项，已获授权 15 项，申请公开的 19 项；先后成功研制开发的 4 种海洋药物和系列海洋生物工程制品都实现了产业化， 创造了巨大的社会效益和经济效益：“九五”期间，研制的三个国家一类新药已进入Ⅱ期临床研究。 研究成果获国家级科技奖励 2 项，省部级科技奖励 10 余项。