南京大学的前身中央大学和金陵大学，都是中国最早进行研究生教育的大学。新中国成立以后，南京大学于1954年恢复研究生招生，直至1965年，全校共招收276名研究生。1978年，南京大学又一次成为全国首批恢复招收研究生的高校之一；1984年，南京大学和21所兄弟院校被列为首批试办研究生院的单位。南京大学研究生院的建立，标志着南京大学的发展进入了一个新的阶段。在1995年初由国务院学位委员会办公室和国家教育委员会对全国33所研究生院综合评估中，南京大学名列第三，被批准正式成立南京大学研究生院。随着南京大学首批进入“211工程”建设以及国家重点建设的高水平大学的行列，南京大学研究生教育进入了一个崭新的发展时期。到2004年9月1日，已授博士学位2474名、硕士学位12615名。目前在校研究生9324名，其中博士生2976名，硕士生6348名，在校博士生人数远远超过25年培养的博士生的总和。

　　南京大学研究生院建院初，就明确以学科建设为龙头，而后学科建设办公室主任由研究生院院长兼任，统筹研究生教育和学科建设工作。目前全校共有18个博士后流动站、16个博士学位授权的一级学科、116个博士学位专业、180个硕士学位专业、6个专业学位授权点。经多年建设，学校拥有了一批新兴交叉学科方向、28个国家重点学科、10个江苏省重点学科、10个国家级重点实验室、11个国家基础学科应用科研和人才培养基地、3个教育部人文社会科学重点研究基地、69个跨学科研究中心。他们为南京大学研究生教育提供了坚实基础。

　　南京大学拥有一批国内外具有重要学术影响的资深学者，集中了一批优秀的中青年学术骨干，他们活跃在指导研究生的第一线，其中中国科学院和工程院院士26名、“国家重点基础研究发展规划”项目首席科学家2名、国家级有突出贡献的中青年专家18名、教育部“长江学者奖励计划”特聘教授24名、国家杰出青年基金获得者59名、教育部“跨世纪优秀人才培养计划”人选35名、“高等学校教学名师”称号获得者3名，在岗博士生导师584名。他们以严谨的治学态度、活跃的学术思想把南京大学的研究生引向科学研究的前沿。

　　南京大学研究生教育围绕南京大学创建世界一流大学的总体目标、开辟南京大学研究生培养和合作科研的广阔渠道。一批著名政治家、社会活动家如前联合国秘书长布托·加利、前美国总统布什、前德国总统约翰内斯·劳、前澳大利亚总理霍克等以及著名科学家吴健雄、袁家骝、许靖华、史蒂文·穆勒等被授予南京大学名誉博士学位；创建了中美文化研究中心、中德经济法研究所等机构共同培养研究生；1994年，南京大学研究生教育走出国门，经教育部批准赴新加坡开办MBA班，先后又在新加坡、马来西亚开办中文硕士、MBA班，与荷兰合办MBA班；目前在校外国留学生和台港澳研究生近300名。

　　南京大学认真落实全国研究生培养工作会议精神和教育部研究生培养创新计划，学校建立了3个研究生创新中心，展开中外课程比较，设立了“南京大学博士研究生专项奖学金”，实行滚动式管理；加速优秀硕士生的培养，试行硕博贯通的“直博生”培养方式，加大硕博连读的选拔力度，吸引和开拓优秀博士生生源；学校制定了“关于对研究生中特殊人才实施个性化培养的暂行办法”，在倡导全面发展的同时，允许一定比例研究生的培养不受该专业培养方案和学校有关培养与学位管理规定的限制，适当放宽博士生学习年限，让他们有充足的时间去进行创新意义较大的研究，有利于“冒尖人才”脱颖而出。

　　近年来，南京大学在研究生招生、培养、学位授予、非学历教育、思想教育管理诸方面取得了可喜成绩。在加强硕士生课程建设、量化学位科研标准方面的实践，获2001年江苏省高等教育教学成果一等奖和2002年教育部国家级教学成果二等奖。南京大学被SCI收录的论文50%以上是在校研究生为第一作者；在《中华人民共和国学位条例》颁布十周年之际，南京大学自己培养的20名毕业生被国务院、教育部授予“在工作中做出突出贡献的中国博士、硕士学位获得者”的光荣称号；研究生招生办公室两次获得全国高校招生工作先进集体荣誉称号。近年来，19位博士获得“全国优秀博士学位论文”奖；20部教材获全国研究生教学用书；由南京大学研究生院负责、与江苏省12所高校共同完成的“研究生教育与重点学科建设研究”、由南京大学研究生院参与、和浙江大学等7所高校共同完成的“中国研究生院设置与建设研究”分别获得中国“九五”学位与研究生教育研究课题研究成果二等奖和一等奖：“新时期研究生党建工作面临的机遇与挑战”获中国学位与研究生教育学会德育工作委员会优秀论文特别奖。

　　随着南京大学“211工程”全面实施和“985工程”二期的启动，为创建世界一流大学，南京大学研究生教育将努力探索高素质创新人才培养的新思路、新模式，确保把提高南京大学研究生培养质量的工作落到实处。