东南大学理学院成立于1990年。下设应用数学，物理，化学化工，生物科学与医学工程4个系及应用数学，应用概率统计，凝聚态物理，现代光学，精细化工，应用静电，生物医学工程7个研究所。目前设有数学与应用数学，应用物理学，化学化工与工艺，生物医学工程4个本科专业。应用数学，概率论与数理统计，运筹学与控制论，基础数学，凝聚态物理，光学，课程与教学论，应用化学，材料物理与化学，化学工艺，生物医学工程等11个学科有硕士学位授予权。应用数学具有博士学位授予权，生物医学工程是江苏省重点学科，具有博士学位授予权，并设有博士后流动站。

　　本院拥有分子与生物分子电子学国家教育部开放实验室（吴健雄实验室）和联合国UNDP资助的医学影像技术实验室以及生物医学仪器，数学实验，中级物理，大学物理，无机化学，有机化学，分析化学，物理化学，精细化工，高分子化学及物理等十多个实验室，实验仪器设备齐全，先进，已成为学院高科技研究的实验基地。

　　全员现有教职工约178人，其中教师141名，教授32名，博士生导师9名，副教授96名，讲师35名。各类在校学生642人，其中本科生516人，硕士生93人，博士生33人。

　　学院有一支朝气蓬勃相对稳定的中青年教师队伍，全院40岁以下青年教师120人，占全体教师的85%，具有博士学位的53人，具有硕士学位的46人。这批人已成为教学科研的骨干力量，代表了我院的未来和希望。

　　本院既承担学校的数学，物理，化学等基础课程的教学任务，又培养应用理科高级科技人才，同时承担多项国家自然科学基金项目，国家“九。五”攻关项目，“863”高新技术项目，国际合作项目以及部，省级科研项目。

　　本院教师一贯注重课程内容和教学方法的改革，不断提高教学质量，在教材建设，课程建设方面也取得了丰硕成果。先后有十余种教材获得全国优秀教材，教育部优秀教材奖，近20个项目分别获部，省，校优秀教学成果奖。

　　近几年来，本院的科学研究工作有了很大的发展，研究的领域不仅涉及到基础理论，应用基础，高新技术，也涉及到一些新的边缘学科和交叉学科。主要研究方向有：非线性微分方程理论与应用，应用统计，代数学及其应用，函数逼近与数值分析，规划论，图论与可靠性理论，经济与管理数学，超导电性，凝聚态物质的输运性质，量子光学，量子混沌，物理教学，应用有机化学，高分子化工，资源与环境化工，功能材料，化学反应工程，表面物化与电化学，精细化工，有机化工，分子与生物分子电学，影像科学与技术，医学电子学，生物信息处理，基因芯片，医学仪器等，有些研究领域已处于国际先进及国内领先行列。

　　已取得的主要科研成果达150项，获奖项目53项，其中获国家发明奖1项，获江苏省科技进步一得奖2项，部，省级科技进步二等奖20项，三等奖23像。每年在国内外核心刊物上发表论文总数及被SCI，EI检索的论文数在全校均名列前茅，出版专著，译著30余部。