现代农业工程系是我校根据我国国民经济发展的需要以及我校学科发展的基础和方向，以原农业水利工程系（农田水利工程系）为基础新成立的校直属系。

　　现代农业工程系的前身农业水利工程系（农田水利工程系）是我校建校初期最早设立的系之一，经过几十年的发展已形成多个强有力的学科群体，学科优势突出，学科服务面宽广。所培养的学生具有基础扎实、专业知识面宽、工作适应能力强的特点，受到用人单位的广泛好评。

　　现代农业工程系现有农业水利工程系和设施农业科学与工程两个本科专业。几十年来农业水利工程（农田水利工程）专业为国家培养了4000多名本、专科生，为亚洲、非洲等许多发展中国家培养了大批留学生和留学研究生，为我国的水利水电事业，尤其是农村水利水电事业的建设做出了重大贡献。设施农业科学与工程专业是教育部根据我国农业现代化的客观要求，于2003年批准我校设立的新专业，该专业培养的学生主要从事工厂化农业生产的科学研究、工程建设和经营管理工作，该专业毕业生将具有良好的就业前景。

　　现代农业工程系现有农业水土工程博士点，农业水土工程和农业生物环境与能源工程硕士点。全系现有教职员工24人，其中教授7人，副教授8人。近五年来，先后承担多项国家攻关项目、国家948项目、863项目、国家自然科学基金项目，以及地方政府及企事业单位科研项目数十项，并取得了显著成绩，获国家科技进步奖1项，省部级科技进步奖十余项。

　　现代农业工程系现有农业水土实验中心、土壤实验室、泵站及小水电站实验室、节水技术实验中心等多个专业实验室，以我系为主参与建设的水利部河海大学节水园区也将成为我系教学、科研实验基地。