化学系主干学科为：化学。本科设化学专业，研究生设无机化学、分析化学和有机化学三个博士点和硕士点，并可接纳博士后研究人员，目前在该系就读的本科生215名，硕士生共92名，博士生71名，博士后研究人员3名。

　　化学系的骨干课程有：高等数学、普通物理、物理实验、线性代数、数理方法、概率统计、电子技术基础及实验、计算机系列基础、无机化学、分析化学、有机化学、物理化学、结构化学、化学工程、配位化学、化学信息学、环境化学等。

　　化学系积极关注化学与生命科学、材料科学、环境科学和计算机科学的交叉，及时将边缘学科的最新进展介绍给全体学生，培养的学生具有坚实的数理化基础、前沿的专业理论和精良的计算机操作和化学实验技能。80%以上的学生被国内外著名大学的研究生院录取，其余学生为中国科学院各研究所和国内大公司聘用。

　　化学系的主要科研方向有超导材料、纳米化学、生物无机化学、稀土配位化学、化学键理论、超分子化学、物理有机化学、生物有机化学、天然产物化学、有机合成化学、分析科学、计算机化学（化学信息学与分析仪器）、环境分析化学、生命分析化学等。