中国科学院南海海洋研究所成立于1959年1月，所址广州，是目前我国规模最大的综合性海洋研究机构之一，2002年2月己进入中国科学院知识创新工程试点序列。全所现有职工393人，设有创新基地固定岗位183个，进入创新试点150人，现有研究员40人，副研78人。拥有海洋科学博士后流动站，海洋生物学、物理海洋学和海洋地质学博士学位授予点，物理海洋学、海洋地质学、海洋生物学、海洋化学、环境科学和水产养殖学硕士授予点，博士导师32人，在读博士研究生78人，硕士生89人，客座流动专家10人，到位“海外杰出人才” 8人。

　　南海海洋所根据我国实施“科技兴海”战略和维护海洋权益以及中科院新时期办院方针的要求，凝炼科技创新目标，以热带海洋环境动力过程、边缘海地质演化、热带海洋生物资源可持续利用为重点创新领域，以热带海洋过程的理论创新为重点，推动海洋应用关键技术的创新和集成，开展海洋矿产资源勘查、海洋生物资源开发利用、海洋工程环境与军事环境评价和预测等方面的社会可持续发展的重大科学问题研究，促进应用开发和成果转化，为国家发展海洋经济和维护海洋权益做出战略性和综合性的重大贡献。

　　该所拥有国家、中科院、省重点实验室（站），包括中科院热带海洋环境动力学重点实验室，中科院边缘海地质与古环境重点实验室（与广州地化所联合建设）、广东省海洋药物重点实验室；物理海洋研究室、海洋环境与生态研究室、应用海洋生物研究室、海洋地质研究室，边缘海与古环境开放实验室，海南热带海洋生物实验站（国家野外重点试验站和中国生态系统研究网络“CERN”站）、大亚湾海洋生物综合实验站（中科院开放站和中国生态系统网络“CERN” 重点站）、湛江海洋经济动物实验站、汕头海洋植物实验站，海洋工程中心和产品开发中心，并拥有“实验2号”、“实验3号”两艘大型海洋科学考察船、图书馆和热带海洋生物标本馆。

　　1998年该所获ISO9002质量认证证书，成为全国海洋科研机构首家获得ISO9002质量体系认证的科研单位，并具有“全国建设项目环境影响评价资格证书（甲级）”、“海域使用可行性论证资格证书（甲级）”、和 “海洋专项工程勘察甲级证书”，国家计量认证合格证书，为完成科研和开发任务提供了良好的保证。南海海洋所现为广州市“文明单位”、广东省直系统“文明单位”和“全国青少年走进科学世界科技活动示范基地”。

　　□ 2003年南海海洋所知识创新试点工作进展和效果1、进一步凝炼了科技创新目标，加快推进了南方海洋科技创新基地的建设。启动13个领域前沿项目，预启动了6个思路新颖、有创新苗头的项目；重新任命了重点实验室、实验室和野外台站负责人，通过重要方向和重大项目的组织和实施，进一步完善了25个学科组建设；该所成立了所领导担纲的共建南方海洋创新基地领导小组和工作组，提出了《中科院、广东省、广州市三方共建南方海洋创新基地的初步方案》。2003年10月8日，基地已经广东省政府常务会原则通过，正在广州分院的协调下，会同广州地化所与广东省科技厅、广东省海洋与渔业局等单位推进共建基地的工作。

　　2、大力进行组织结构调整和机构改革。按照产权清晰、权责明确、管理科学的原则，成立了“广州市科健物业管理有限责任公司”，实行股份制管理，推进研究所后勤服务社会化。公司分流18名所职工，与所签订了卫生、绿化、幼儿园、饭堂、保安等委托管理合同，并完成了250股职工内部认购股：“广州市南科海洋环境工程中心”转制为“广州市南科海洋工程勘察有限公司”，实行股份制管理，按企业法人运作。

　　3、在人、财、物等方面给予政策倾斜，使重点实验室创新科研单元和科研平台的建设取得佳绩：中科院边缘海地质重点实验室2003年8月通过论证；广东省海洋药物重点实验室顺利通过验收，并实现该所争取广东省基金团队资助零的突破；由该所和香港科技大学联合共建的“三亚海洋科学联合实验室”，在2003年中国科学院联合实验室评估中被评为优秀；由广州能源所、广州地化所和南海海洋所联合组建的中国科学院天然气水合物研究中心基本完成论证准备。

　　4、举办了首届中国科学院海洋科学年会，提升了所的知名度和影响力。

　　2003年12月，由南海海洋所、海洋所、广州地化所在广州主办，南海海洋所承办这次盛会。中科院资环局、广东省科技厅等部门和主办所的140名领导、专家和代表参加。刘瑞玉、秦蕴珊、胡敦欣3位院士和有关专家作了大会报告，会议收到论文80篇，分别论述了海洋环境、海洋生态与生物资源、海洋地质和海洋生物技术等问题，广泛交流了海洋科学发展战略和最新成果。

　　5.深化用人制度和分配制度改革，完善规范化的分配与激励机制。

　　完善“关于调整岗位绩效津贴制度的暂行办法”、“基地科研人员绩效考核试行办法”等，重点加强了科技评价体系制度的建立，建立起岗位津贴和绩效工资为主的分配机制，定期考核动态管理的流动机制。从而形成了定量评估与定性评价结合、以绩效评估为核心，以量化评价为基础，以科研人员个人和科研活动组织单元为评价对象的评价体系和制度；2003年还为15名职工办理了离岗退养手续。

　　6.吸引和培养优秀人才，加速科技创新队伍建设。

　　推行“关于引进优秀人才购房补贴的若干规定”等措施，加强“百人计划”和“海外优秀人才计划”的引进工作。2003年到位“百人计划”3人， 接收7名博士和7名硕士来所工作；加强了管理队伍建设，从国内招聘了2名管理骨干，项目聘任财务人员1人；招收博士生40名，硕士生39名，在读研究生175人，研究生招生数量创历史新高，填补了南海海洋所乃至整个华南地区长期无海洋科学博士后流动站的历史空白；制定和实施“科技副职基金管理办法”，探索和加强科技副职工作的管理。

　　7.加快研究生及客座人员公寓、科研实验楼和所区基础设施改造等园区建设步伐；加强思想政治工作、精神文明建设和创新文化建设，召开了“南海海洋所精神、创新价值观和文化特征研讨会”，2003年为该所“制度年”，开始修订新一系列的规章制度汇编。

　　□ 2003年争取和承担的主要科研任务和项目

　　2003年在研课题277项（国家自然科学基金29项，“863”计划9项，“973”计划16项，攻关计划8项，创新重要方向性项目38项，广东省重大专项和百项工程13项，“十五”科技计划3项，地方任务43项，企业委托90项），比2002年增加36项，按年度计划完成273项，完成率99％；新增课题（含项目、课题、子课题）159项。

　　□ 2003年取得的成果和获奖情况

　　2003年发表科技论文220篇（其中国外发表论文46篇，SCI论文58篇），论著5本；申请专利22项，被授予专利权5项（其中发明专利4项）；组织成果鉴定1项，上报中科院成果登记23项；获广东省科学技术奖、广东省农业技术推广奖3项；主持的中科院知识创新工程重要方向项目“南海西北部与红河地区的深部结构及其动力机制研究”、“西太平洋暖池动力过程与海气相互作用”和参加的院知识创新工程重要方向项目“中国近海关键动力过程及其环境效应研究”于2003年底顺利通过验收。

　　□ 科技开发方面的工作情况和效益

　　海洋环境工程中心签订“四技”合同共90项；所与地方合作项目149个；成功推广科技成果3项，实现社会经济效益7.5亿元；在研科研课题59项，2003年申请到的地方资助项目共16项；实施科技成果产业化项目5项，社会经济效益1400万元，推广成果所产生的社会经济效益约3亿元；与地方政府和产业部门共建“广东海洋与水产高科技园”、“广东海珠海洋生物技术产业开发示范基地”、“国家863计划海水养殖种子工程南方基地”；与广东、广西、海南、福建、浙江、辽宁等地有关部门进行科技咨询、合作开发30多次；推荐11位专家担任政府、企业科技顾问；派出3名科技人员到广西挂职；举办海洋生物技术产业化讲座、培训班40余次，约1200人次参加；与中央电视台“走进科学”栏目合拍科教片《生态型海水晶》、“科技苑”栏目合拍《对虾集约式防病养殖新模式》并播出，在社会上反响热烈；参与起草“海南热带陆海生物资源保护和利用科技创新工程”重大计划报告书给国务院。

　　□ 国际合作

　　共开展国际合作与交流项目7项（院级项目2项，科技部1项）；接待来访30批85人次，派出27批46人次。

　　承办“海洋环流与气候变化”国际学术研讨会。会议由院人教局等单位资助并经院国际合作局批准，由该所热带海洋环境动力重点实验室承办，11月28日至12月1日在三亚召开。美国、澳大利亚、韩国、台湾和香港的十多位科学家以及国内著名院士、青年学者等50余人到会。会议就海洋环境与气候变化领域的最新研究成果和发展前景进行了交流与讨论，有利于提高我院的海洋环境动力学的研究水平，促进国际间的学术交流与合作。

　　承办UNEP/GEF“扭转南中国海与泰国湾环境退化趋势”项目海草和珊瑚礁专题区域工作会。受联合国环境组织与国家环保总局的委托，该所海草专题组于11月27日至12月2日在广州承办了UNEP/GEF“扭转南中国海与泰国湾环境退化趋势”项目海草和珊瑚礁2个专题区域工作会，来自10多个国家和地区的与会代表共30人。会上初步确定的海草优先示范区中，包括该所主持研究的广西合浦海草场，为中国海草生态系统的深入研究打下良好的基础。

　　□ 挂靠学会、出版物

　　广东省海洋湖沼学会和广东海洋学会、中国海洋学会海洋物理分会、中国第四纪研究委员会珊瑚礁分委员会、广州欧美同学会留苏分会挂靠在南海所。编辑出版的学术刊物有《热带海洋学报》（核心期刊）、《南海海洋科学集刊》和《南海研究与开发》。