哈尔滨医科大学由原哈尔滨医科大学（其前身为医学先驱伍连德博士于1926年建立的哈尔滨医学专门学校）和原兴山中国医科大学第一、二分校（其前身为中国共产党于1931年在江西瑞金建立的中国工农红军卫生学校）合并组建而成，具有悠久的历史和光荣的传统。在70多年的创建和发展中，学校传承了伍连德博士“赤诚爱国、自强创业”的精神，发扬了中国工农红军卫校“政治坚定、技术优良”的光荣传统，成为具有适度规模和鲜明特色的高等医学院校，是黑龙江省重点建设的“211工程”院校之一。

　　全校校园面积123万平方米（1840亩），建筑面积85万平方米。全校教学科研医疗等仪器设备总值5.7亿元。1996年开始建立了比较完备的校园网络。学校图书馆馆藏图书56.5万册、期刊2262种、中英文全文电子期刊1.3万种、中文电子图书2万册，可提供电子文献检索和网络信息服务。

　　学校设有基础医学学院、公共卫生学院、人文社会科学系、药学院、第一至第七临床医学院、口腔医学院、护理学院、成人教育学院（继续教育学院）等附属单位。

　　国家理科基础科学研究与教学人才培养基地、中国疾病预防控制中心地方病控制中心、国家新药临床试验研究中心、卫生部俄语培训中心、中国医学科学院黑龙江分院、黑龙江省医学科学院等设在我校。

　　学校设置11个本科专业：基础医学（七年制）、临床医学（七年制、六年制日语医学班、六年制俄语医学班、五年制）、预防医学、口腔医学、麻醉学、医学影像学、护理学、药学、生物技术、公共事业管理、法学（卫生法学方向）。

　　学校有一级学科博士学位授权点3个（基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学），二级学科博士学位授权点36个，三级学科博士学位授权点50个、硕士学位授权点55个。建有博士后科研流动站5个、博士后科研工作站2个。有国家级重点学科1个，省级重点学科20个，省部共建生物医药国家重点实验室培育基地1个，部省级重点实验室4个，省普通高校重点实验室7个。有国家特聘教授岗位学科1个，省特聘教授岗位学科22个。

　　学校有教职工7151人，其中有教师2285人。教师中，有专任教师1151名，其中，教授324名、副教授289名、讲师249名、助教289名。有兼职教师1134名，其中，副教授以上教师546名。教师中，有中国工程院院士1人，国务院学位委员会学科评议组成员3人，全国医学专业学位教育指导委员会委员2人，博士生导师132人，硕士生导师456人，国家、卫生部、省有突出贡献的中青年专家20人，享受政府特殊津贴专家104人。获南丁格尔奖教师1人，获中国高校青年教师奖、国家杰出青年科学基金、教育部“高等学校骨干教师资助计划”优秀骨干教师和骨干教师、国家百千万人才工程第一、二层次人选、吴阶平医学研究奖、保罗？杨森药学研究奖、霍英东青年教师基金和青年教师奖、全国留学归国先进个人等29人次。

　　现有各类在校学生9228名。其中，博士、硕士研究生1593名，本科生4821人，成人教育学生2197人。建校以来，培养学生3万多名，毕业生遍布国内外，涌现出一批知名学者。

　　科研工作近几年取得了显著进展。2000年以来，获国家科技进步二等奖3项、国家自然科学二等奖1项、部省级科研成果奖133项；承担国家“973”项目子课题1项、“863”项目子课题2项、国家自然科学基金重点项目1项、国家自然科学基金资助项目95项。亚砷酸注射液治疗M3型白血病研究被中国科学院《2000年科学发展报告》评为20世纪中国十大科技发明之一；中国人类基因组计划、实体瘤的细胞遗传学研究、系列性脾保留性手术的基础与临床研究、同种原位心脏移植的实验和临床应用研究、抗心律失常药物作用最佳靶点的研究、大骨节病病因学研究等研究领域取得突破性进展。主编《中国地方病学杂志》、《国外医学·遗传学分册》、《国外医学·免疫学分册》等6种专业期刊。先后同美国、日本、加拿大、澳大利亚、英国、俄罗斯、德国、芬兰、韩国等12个国家和地区的40余所院校建立了友好校际关系。

　　学校三所附属医院（第一、二、三临床医学院）均为“三级甲等”医院，其中两所被卫生部授予全国“百佳医院”。三所附属医院和口腔医学院编制床位共3514张，年门诊量160余万人次，年收住院病人近11万人次。在同种异体劈裂脾移植、心脏移植、同种异体双手移植、同种异体单前臂移植等器官移植领域居国内先进水平，有的已达到国际水平；大肠癌的综合治疗等在国内有较大影响。另有四所非隶属的临床医学院（第四、五、六、七临床医学院），有床位2905张。