武汉物理与数学研究所坐落于风景秀丽的武汉东湖之滨、小洪山麓。她由原武汉物理所（成立于1958年）和原武汉数学物理所（重建于1979年）于1996年合并而成。1997年成为中科院18个基础研究基地型研究所之一，1999年基础研究主体的三个实验室进入中科院知识创新试点工程，2001年全所进入中科院知识创新试点序列。研究所发展的总目标是：以波谱与原子分子物理、电离层物理和数学物理的基础研究为主，发展相关的应用研究和高新技术，建成国际著名的研究所。

　　经过不断的优化调整，现在的物数所形成了“三室一中心”的学科结构。以波谱与原子分子物理国家重点实验室、电离层物理实验室、数学物理实验室和高技术研究与发展中心为科研基地，开展核磁共振波谱学、原子分子物理、电离层物理和数学物理领域的基础和应用基础研究，以及以原子频率标准、超声无损检测与成象技术和磁共振新方法与技术为主的高技术研究与发展工作。

　　建所以来，本所共取得科技成果近300项，包括国家科技进步一等奖、国家自然科学二等奖等国家级成果。1999年以来，获省部级科技成果奖12项。每年发表SCI论文近200篇，论文数量和质量逐年提高。

　　进入创新工程以来，物数所提出了5年科研总目标，即“5年内建成国际著名研究所 （院前30名）。波谱与原子分子物理、电离层物理、数学物理方面总体研究水平达到国际先进，部分工作国际领先；国家磁共振研究中心和原子分子物理研究基地高技术创新方面承担国防重大项目；向市场提供具有重大经济效益的高新技术成果。”在研究所科研人员的共同努力下，仅最近两年，研究所就争取到在研课题两百余项，承担重大科研项目近一百项，其中决大部分是“973、863”等国家级重点科研项目。

　　本所现有员工265人，其中科技人员177人，中科院院士1人，正副高级研究人员89人，中级专业技术人员69人。现有在读研究生180人，在站博士后8人。每年来所工作的高级客座人员约15人。研究所还建有1 个博士后流动站，4个博士授予点，7个硕士授予点。近年来本所不断适应改革与发展的需要，在调整、优化、精简机构设置的同时，逐步建立以“开放、流动、竞争、协作”为基础的人才吸引、培养、使用、激励制度，立足培养，广聘良才，引进高层次优秀人才。

　　研究所科研装备条件优良并不断改造更新，拥有适量的现代化科研仪器装备。其中包括：多台液体、固体核磁共振谱仪，动物磁共振成象仪，多种波长或可调谐的连续、脉冲（ns~fs）固体或染料激光器和半导体激光器，磁光阱、离子阱实验装置，原子外场实验装置，原子刻蚀装置和交叉分子（原子）束实验装置，双波长激光雷达、数字测高仪、流星雷达以及多CPU工作站等重要仪器装备。本所已实现了计算机与国际互联网的高速联通，中科院武汉网络中心也依托在本所。

　　本所与欧美等20余个科技发达的国家与地区建立了学术交流与合作关系，每年来访和出访的专家学者达40余人次。包括诺贝尔奖获得者Bloembergen教授、Ernst教授等多名国际著名学者曾来所进行学术访问与合作研究。

　　近年来，本所在院地合作方面成效显著。不仅与地方企业共同组建了“兴科科技股份公司”和“东软波谱股份有限公司”，还与湖北省共建了“武汉磁共振中心”。本所与武汉大学、华中科技大学等周边高校签订了全面合作协议，建立了人才培养、优势学科强强联合与科研条件资源共享等有效的合作关系。

　　本所是中国物理学会的常务理事单位，全国波谱学专业委员会的挂靠单位，湖北省暨武汉物理学会理事长单位。近年来举办了 “原子分子物理前沿”、“核磁共振新技术方法”和“数学分析”等国际学术会议。主办的《数学物理学报》（中、英文版）和《波谱学杂志》均为我国自然科学的核心刊物，英文版《数学物理学报》为SCI收录期刊。