江苏省中国科学院植物研究所的前身系建立于1929年孙中山先生纪念植物园和创建于 1934年的中央研究院动植物研究所。孙中山先生纪念植物园是由钱崇澍、秦仁昌、叶培忠等教授所倡导建立的。叶培忠为植物园负责人。1950年演变成为中国科学院植物分类研究所华东工作站。1954年由吴征镒、俞德浚教授筹备经政务院批准，由中国科学院植物研究所华东工作站负责，在裴鉴研究员主持下，重建植物园，定名为中国科学院南京中山植物园。1960年扩建为中国科学院南京植物研究所。裴鉴任所长。

　　1970年后，下放改称江苏省植物研究所，亦名南京中山植物园。1978年由单人骅研究员任所长。1983年由贺善安研究员任所长。1993年再实行江苏省与中国科学院双重领导，定名为江苏省中国科学院植物研究所。所长贺善安。

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